Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UPK3BL2E5RIL1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPK3BL2E5RIL1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPK3BL2E5RIL1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms