Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
3425401B19RikD3Z1D3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms