Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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Gm17333C6EQI3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Gm17333C6EQI3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Gm17333C6EQI3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Gm17333C6EQI3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Gm17333C6EQI3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Gm17333C6EQI3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Gm17333C6EQI3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gm17333C6EQI3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Gm17333C6EQI3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm17333C6EQI3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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