Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud7bB2RUR8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud7bB2RUR8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud7bB2RUR8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud7bB2RUR8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud7bB2RUR8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud7bB2RUR8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud7bB2RUR8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud7bB2RUR8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud7bB2RUR8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud7bB2RUR8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Otud7bB2RUR8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Otud7bB2RUR8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Otud7bB2RUR8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Otud7bB2RUR8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Otud7bB2RUR8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms