Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PtprbB2RU80 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PtprbB2RU80 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PtprbB2RU80 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms