Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rrn3B2RS91 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rrn3B2RS91 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rrn3B2RS91 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rrn3B2RS91 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrn3B2RS91 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrn3B2RS91 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrn3B2RS91 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrn3B2RS91 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrn3B2RS91 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrn3B2RS91 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrn3B2RS91 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrn3B2RS91 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rrn3B2RS91 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrn3B2RS91 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrn3B2RS91 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrn3B2RS91 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrn3B2RS91 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rrn3B2RS91 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms