Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Ythdc2B2RR83 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Ythdc2B2RR83 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ythdc2B2RR83 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ythdc2B2RR83 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ythdc2B2RR83 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ythdc2B2RR83 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ythdc2B2RR83 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ythdc2B2RR83 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ythdc2B2RR83 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ythdc2B2RR83 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ythdc2B2RR83 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ythdc2B2RR83 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ythdc2B2RR83 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ythdc2B2RR83 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ythdc2B2RR83 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ythdc2B2RR83 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
Ythdc2B2RR83 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.89
Ythdc2B2RR83 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Ythdc2B2RR83 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ythdc2B2RR83 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ythdc2B2RR83 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.85
Ythdc2B2RR83 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms