Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Brpf3B2KF05 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Brpf3B2KF05 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Brpf3B2KF05 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms