Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Otud3B1AZ99 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otud3B1AZ99 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms