Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prr29B1ARI9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prr29B1ARI9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prr29B1ARI9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prr29B1ARI9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms