Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmem238A9JSM3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tmem238A9JSM3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem238A9JSM3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms