Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ARID3CA6NKF2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
ARID3CA6NKF2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ARID3CA6NKF2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ARID3CA6NKF2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ARID3CA6NKF2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ARID3CA6NKF2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ARID3CA6NKF2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ARID3CA6NKF2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ARID3CA6NKF2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
ARID3CA6NKF2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ARID3CA6NKF2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ARID3CA6NKF2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
ARID3CA6NKF2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
ARID3CA6NKF2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ARID3CA6NKF2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ARID3CA6NKF2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ARID3CA6NKF2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
ARID3CA6NKF2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.49
ARID3CA6NKF2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
ARID3CA6NKF2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ARID3CA6NKF2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms