Protein–RNA interactions for Protein: A6NDG6

PGP, Glycerol-3-phosphate phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPA6NDG6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGPA6NDG6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPA6NDG6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms