Protein–RNA interactions for Protein: A4FU28

CTAGE9, cTAGE family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE9A4FU28 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTAGE9A4FU28 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTAGE9A4FU28 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTAGE9A4FU28 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms