Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fibcd1A2AV25 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fibcd1A2AV25 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fibcd1A2AV25 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fibcd1A2AV25 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms