Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hacd4A2AKM2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hacd4A2AKM2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hacd4A2AKM2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms