Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pkd2l1A2A259 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pkd2l1A2A259 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkd2l1A2A259 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkd2l1A2A259 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pkd2l1A2A259 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2l1A2A259 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2l1A2A259 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2l1A2A259 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2l1A2A259 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2l1A2A259 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2l1A2A259 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pkd2l1A2A259 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms