Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
POTEB3A0JP26 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
POTEB3A0JP26 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
POTEB3A0JP26 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms