Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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