Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AUP1Q9Y679 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AUP1Q9Y679 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AUP1Q9Y679 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms