Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX13Q9Y5W8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX13Q9Y5W8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX13Q9Y5W8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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