Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCDHB4Q9Y5E5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHB4Q9Y5E5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHB4Q9Y5E5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms