Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K0

LOXL2, Lysyl oxidase homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL2Q9Y4K0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LOXL2Q9Y4K0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LOXL2Q9Y4K0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LOXL2Q9Y4K0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms