Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FARSAQ9Y285 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FARSAQ9Y285 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms