Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PapolbQ9WVP6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PapolbQ9WVP6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PapolbQ9WVP6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms