Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nme3Q9WV85 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nme3Q9WV85 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nme3Q9WV85 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118 ms