Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV18

Gabbr1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabbr1Q9WV18 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabbr1Q9WV18 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabbr1Q9WV18 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabbr1Q9WV18 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabbr1Q9WV18 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabbr1Q9WV18 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabbr1Q9WV18 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabbr1Q9WV18 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabbr1Q9WV18 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabbr1Q9WV18 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabbr1Q9WV18 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabbr1Q9WV18 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabbr1Q9WV18 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabbr1Q9WV18 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabbr1Q9WV18 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabbr1Q9WV18 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabbr1Q9WV18 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabbr1Q9WV18 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabbr1Q9WV18 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabbr1Q9WV18 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gabbr1Q9WV18 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gabbr1Q9WV18 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gabbr1Q9WV18 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms