Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK4

Rfc2, Replication factor C subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc2Q9WUK4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rfc2Q9WUK4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rfc2Q9WUK4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rfc2Q9WUK4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rfc2Q9WUK4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms