Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SORCS3Q9UPU3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SORCS3Q9UPU3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SORCS3Q9UPU3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SORCS3Q9UPU3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms