Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS11EQ9UL52 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS11EQ9UL52 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS11EQ9UL52 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms