Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GTF2IRD1Q9UHL9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GTF2IRD1Q9UHL9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GTF2IRD1Q9UHL9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms