Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cry2Q9R194 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cry2Q9R194 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cry2Q9R194 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cry2Q9R194 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms