Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0K7

Atp2b2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b2Q9R0K7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp2b2Q9R0K7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp2b2Q9R0K7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Atp2b2Q9R0K7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp2b2Q9R0K7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp2b2Q9R0K7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp2b2Q9R0K7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Atp2b2Q9R0K7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atp2b2Q9R0K7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Atp2b2Q9R0K7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atp2b2Q9R0K7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atp2b2Q9R0K7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp2b2Q9R0K7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp2b2Q9R0K7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp2b2Q9R0K7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp2b2Q9R0K7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp2b2Q9R0K7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp2b2Q9R0K7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atp2b2Q9R0K7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atp2b2Q9R0K7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atp2b2Q9R0K7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms