Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ubxn8Q9QZ49 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ubxn8Q9QZ49 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ubxn8Q9QZ49 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms