Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SpastQ9QYY8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SpastQ9QYY8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SpastQ9QYY8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms