Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxe3Q9QY14 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxe3Q9QY14 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxe3Q9QY14 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Foxe3Q9QY14 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Foxe3Q9QY14 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Foxe3Q9QY14 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms