Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpc5Q9QX29 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trpc5Q9QX29 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Trpc5Q9QX29 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trpc5Q9QX29 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms