Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWZ1

Rad1, Cell cycle checkpoint protein RAD1, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad1Q9QWZ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rad1Q9QWZ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad1Q9QWZ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad1Q9QWZ1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad1Q9QWZ1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad1Q9QWZ1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad1Q9QWZ1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad1Q9QWZ1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad1Q9QWZ1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad1Q9QWZ1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad1Q9QWZ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad1Q9QWZ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad1Q9QWZ1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad1Q9QWZ1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad1Q9QWZ1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad1Q9QWZ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad1Q9QWZ1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad1Q9QWZ1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rad1Q9QWZ1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms