Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KLHL9Q9P2J3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KLHL9Q9P2J3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLHL9Q9P2J3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms