Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SACSQ9NZJ4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SACSQ9NZJ4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SACSQ9NZJ4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms