Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC2

TREM2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM2Q9NZC2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREM2Q9NZC2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TREM2Q9NZC2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TREM2Q9NZC2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TREM2Q9NZC2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TREM2Q9NZC2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TREM2Q9NZC2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms