Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TVP23BQ9NYZ1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
TVP23BQ9NYZ1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TVP23BQ9NYZ1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms