Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNAJC17Q9NVM6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAJC17Q9NVM6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAJC17Q9NVM6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms