Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNFRSF19Q9NS68 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TNFRSF19Q9NS68 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.6 ms