Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAPOLBQ9NRJ5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms