Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPRD1BQ9NQG5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPRD1BQ9NQG5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPRD1BQ9NQG5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms