Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ89

C12orf4, Protein C12orf4, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf4Q9NQ89 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf4Q9NQ89 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf4Q9NQ89 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf4Q9NQ89 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf4Q9NQ89 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C12orf4Q9NQ89 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C12orf4Q9NQ89 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C12orf4Q9NQ89 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C12orf4Q9NQ89 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C12orf4Q9NQ89 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms