Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IL1RAPQ9NPH3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
IL1RAPQ9NPH3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IL1RAPQ9NPH3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms