Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO1B3Q9NPD5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms