Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACKR4Q9NPB9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ACKR4Q9NPB9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACKR4Q9NPB9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms